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Organisme privé, en grande partie financé par l'État (Ministère de la Culture et de la Communication via le Centre National de la Cinématographie), la Cinémathèque française est une association de type loi 1901, à but non lucratif.
Elle rassemble aujourd'hui près de 650 membres, personnes physiques ou morales, réalisateurs, comédiens, chercheurs, critiques, techniciens, cinéphiles, qui ont déposé ou fait don d'une œuvre ou d'un document cinématographique. L'adhésion permet aux déposants et donateurs de devenir membres de l'Assemblée Générale. Ils participent ainsi à l'élection tous les trois ans de la moitié renouvelable du Conseil d'administration de la Cinémathèque française.
Ce dernier comprend dix-huit membres élus par l'Assemblée Générale. Chaque administrateur dispose d'un mandat de six ans. L'Etat nomme trois personnalités qualifiées et est représenté par un Commissaire du Gouvernement (le Directeur Général du CNC) et un contrôleur financier.
Le Conseil d'Administration élit le Bureau composé du Président et du Trésorier (pour trois ans), et du ou des Vice-Présidents et Secrétaires (pour un an).
Le Directeur Général de la Cinémathèque française est nommé par le Conseil d'Administration sur proposition du Président, après agrément du Ministre de la Culture et de la Communication.
Les Statuts de l'association, modifiés lors de l'Assemblée Générale extraordinaire du 22 septembre 2003, ont permis la mise en place d'un comité financier, instance paritaire entre la Cinémathèque et l'Etat. Il est présidé par le président de la Cinémathèque française.

Matthieu Orléan est collaborateur artistique à la Cinémathèque française, chargé des expositions temporaires depuis 2003. Pour la cinémathèque, il a été commissaire de l’exposition sur Almodóvar. Il écrit depuis 1998 sur le cinéma et les arts plastiques pour la presse écrite (Cahiers du Cinéma, Trafic, Vertigo, Synopsis, Art Press, Libération, Purple…), et pour différents ouvrages (Autoportrait en cinéaste, Chantal Akerman et Raymond Hains, J’ai la mémoire qui planche, tous deux aux éditions du Centre Pompidou, Trésors publics : 20 ans de création dans les Fonds régionaux d’art contemporain aux éditions Flammarion). Au printemps 2006, Orléan a publié une partie de son travail photographique dans le numéro 7 du magazine Roses tatouées. Auteur, critique, et homme d'art avant tout, il se lance dans la réalisation en compagnie de Christian Merlhiot sur le film Des Indes à la planète Mars.