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Inria
4. Sequences comparison
Table of contents
4.1. How to predict gene/protein functions?
4.2. Why gene/protein sequences may be similar?
4.3. Measuring sequence similarity
4.4. Aligning sequences is an optimization problem
4.5. A sequence alignment as a path
4.6. A path is optimal if all its sub-paths are optimal
4.7. Alignment costs
4.8. A recursive algorithm
4.9. Recursion can be avoided: an iterative version
4.10. How efficient is this algorithm?
-
Sciences fondamentales
Vidéocours
5 min
LABEL UNT
4.1. How to predict gene/protein functions?
-
Sciences fondamentales
Vidéocours
5 min
LABEL UNT
4.2. Why gene/protein sequences may be similar?
-
Sciences fondamentales
Vidéocours
4 min
LABEL UNT
4.3. Measuring sequence similarity
-
Sciences fondamentales
Vidéocours
5 min
LABEL UNT
4.4. Aligning sequences is an optimization problem
-
Sciences fondamentales
Vidéocours
4 min
LABEL UNT
4.5. A sequence alignment as a path
-
Sciences fondamentales
Vidéocours
5 min
LABEL UNT
4.6. A path is optimal if all its sub-paths are optimal
-
Sciences fondamentales
Vidéocours
7 min
LABEL UNT
4.7. Alignment costs
-
Sciences fondamentales
Vidéocours
8 min
LABEL UNT
4.8. A recursive algorithm
-
Sciences fondamentales
Vidéocours
7 min
LABEL UNT
4.9. Recursion can be avoided: an iterative version
-
Sciences fondamentales
Vidéocours
10 min
LABEL UNT
4.10. How efficient is this algorithm?
