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Résultats de recherche

Nombre de programmes trouvés : 308
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le (9m8s)

1.9. Predicting the origin of DNA replication?

We have seen a nice algorithm to draw, let's say, a DNA sequence. We will see that first, we have to correct a little bit this algorithm. And then we will see how such as imple algorithm can provide biological results. Again, this is the aim of bioinformatics: analysing the genomic texts and providing biological results. So, you remember that we had to deal with the problem of the screen size and for that, we decided to change the first version of the algorithm and we introduced a window of fixed length. And we get this algorithm. So, in this algorithm, we repeat the analysis within the window and ...
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Conférences

le (8m55s)

RDV Santé Inserm : Devenir chercheur, chercheur en devenir

Des médecins-chercheurs réunis par l'Inserm engagent la discussion avec des étudiants à la faculté de médecine de Necker. La recherche est-elle ouverte à tout le monde ? Premier ou dernier de la classe, qui a ses chances ? En réalité au-delà du niveau scolaire, la recherche, c'est la conquête de l'inconnu, c'est faire travailler l'imagination. Créativité et originalité sont deux éléments-clé qui dépassent allégrement le critère convenu de sélection des étudiants par le niveau en maths.
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le (8m22s)

2.8. DNA sequencing

During the last session, I explained several times how it was important to increase the efficiency of sequences processing algorithm because sequences arevery long and there are large volumes of sequences, so it's now the time to ask: but where these sequences come from? This is the process of sequencing. DNA sequencing is a physical operation through which a DNA molecule is read, that is every nucleotide along the strand of the molecule is read and then a text is producedas a succession of the nucleotides as letters. So from the DNA molecule tothe text through what is a sequencer. Sequencers are smaller and smaller and smaller and they ...
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le (7m53s)

2.3. Le code génétique

Gènes et protéines, mais qu'est-ce qu'une protéine ? Une protéine, c'est également une molécule qui est constituée d'une succession de ce que l'on appelle les acides aminés. C'est donc une chaîne d'acides aminés qui sont des motifs chimiques élémentaires. Il existe 20 acides aminés distincts. Chacun de ces acides aminés peut être désigné soit par son nom complet, soit par un nom à 3 lettres, soit par un nom simple à une seule lettre. Conséquence : une protéine peut, au niveau le plus primaire, être modélisée elle aussi par une chaîne de caractères. Mais cette chaîne de caractères est écrite ...
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le (7m42s)

4.8. A recursive algorithm

We have seen how we can computethe optimal cost, the ending node of our grid if we know the optimal cost of the three adjacent nodes. This is this computation scheme we can see here using the notation of the pseudo code and not the mathematical notation we used in the previous sessions. So again we can compute the cost of this node if we know the cost of that node, that node and that node and we have to add respectively the insertion cost, the substitution cost orthe insertion cost. The substitution cost here depends on the letter at this position in the sequence and this letter ...
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