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Résultats de recherche

Nombre de programmes trouvés : 828
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le (4m29s)

1.6. GC and AT contents of DNA sequence

We have designed our first algorithmfor counting nucleotides. Remember, what we have writtenin pseudo code is first declaration of variables. We have several integer variables that are variables which cantake as a value an integer. One, two, three minus five and so on. We have the sequence of characters we want to interpret, declare as a character string oflengths and define. Then we have the initializationof our different variables. This symbol is a symbol for assignment, it means that zero becomes the value of total nb, nbT and soon and so on and here we say: index takes the value one. It means that we position at the beginning of ...
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le (4m23s)

4.4. Aligning sequences is an optimization problem

We have seen a nice and a quitesimple solution for measuring the similarity between two sequences. It relied on the so-called hammingdistance that is counting the number of differencesbetween two sequences. But the real situation is a bitmore complex as we'll see now, it needs an adequatesolution and algorithm. Why is it a bit more complex? Let's have a look at thispair of two sequences. If we apply the hamming distance,compute the hamming between these two sequences,we find ten differences. OK. But you must remember thatmutation may be substitution, deletion and insertion. So if wetake into account the deletion and insertion, the situation isvery different in the case of these two sequences. ...
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le (4m12s)

4.6. A path is optimal if all its sub-paths are optimal

A sequence alignment between two sequences is a path in a grid. So that, an optimal sequence alignmentis an optimal path in the same grid. We'll see now that a property of this optimal path provides us with scanned lines for designing an optimization algorithm. The property is the following. A path which is optimal is made up of optimal sub-paths. To prove that, we can start byproving that if a path of length L is optimal then the path of length L minus one is also optimal. This can be proved quiteeasily ad arburdum. That is, you take the hypothesis that the path of length L is optimal ...
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le (4m0s)

4.3. Measuring sequence similarity

So we understand why gene orprotein sequences may be similar. It's because they evolve togetherwith the species and they evolve in time, there aremodifications in the sequence and that the sequence may still besimilar, similar enough again to retrieve information on onesequence to transfer it to another sequence of interest. So thequestion now is how can we measure this similarity between twosequences for the moment. The first approach to similarityis a very simple one is to apply a distance which is calledhere the Editing System or the Hamming Distance.The idea is very basic. You would take two sequences likethese two sequences here and you look at the differences and youcount ...
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Label UNT Vidéocours

le (3m51s)

4.5. A sequence alignment as a path

Comparing two sequences and thenmeasuring their similarities is an optimization problem. Why? Because we have seen thatwe have to take into account substitution and deletion. During the alignment, the comparison of the two sequences, we haveto insert blank characters at a certain position in order tohave an optimal score that is we want the sequence to be themore similar as possible. So the problem is to find whereto locate the blank character. There are many solutions and wewant to find the best one, it is an optimization problem. How do we deal with thisoptimization problem? We will consider an alignmentbetween two sequences as a path in that kind of grid. Here ...
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Label UNT Travaux pratiques

le (3m46s)

Glissements de terrains (2003)

En référence à un tremblement de terre qui s'est produit en Algérie, Arnaud LEMAISTRE, médiateur scientifique au département sciences de la Terre du Palais de la découverte, montre une maquette permettant de simuler le mécanisme de rupture entre deux failles. Cette maquette est constituée de deux pièces en bois superposées présentant une surface de contact rugueuse. Si l'on tire sur la partie supérieure par l'intermédiaire d'un fil élastique, un glissement apparaît à un certain moment. On constate que les intervalles de temps qui séparent deux déclenchements successifs du glissement sont très variables. C'est ce caractère saccadé non reproductif qui empêche ...
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Label UNT Documentaires

le (3m41s)

Le miroir à retournement temporel

Ce clip présente une méthode de contrôle non destructif par ultrasons mise au point par le laboratoire Ondes et acoustique et la société SNECMA. Elle utilise un miroir à retournement temporel qui est ici présenté par son inventeur Mathias Fink. Le miroir émet des ultrasons. Si ceux-ci sont réfléchis par un défaut dans la pièce à contrôler, ils reviennent vers le miroir qui les renvoie à nouveau vers le défaut, le signal étant amplifié à chacun de ces retournements temporels. La méthode est appliquée à des pièces en titane pour moteurs d'avions.GénériqueRéalisateur : Jean-François Ternay Producteur : CNRS Audiovisuel Diffuseur ...
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