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Résultats de recherche

Nombre de programmes trouvés : 1291
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le (4m29s)

1.6. GC and AT contents of DNA sequence

We have designed our first algorithmfor counting nucleotides. Remember, what we have writtenin pseudo code is first declaration of variables. We have several integer variables that are variables which cantake as a value an integer. One, two, three minus five and so on. We have the sequence of characters we want to interpret, declare as a character string oflengths and define. Then we have the initializationof our different variables. This symbol is a symbol for assignment, it means that zero becomes the value of total nb, nbT and soon and so on and here we say: index takes the value one. It means that we position at the beginning of ...
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le (4m23s)

4.4. Aligning sequences is an optimization problem

We have seen a nice and a quitesimple solution for measuring the similarity between two sequences. It relied on the so-called hammingdistance that is counting the number of differencesbetween two sequences. But the real situation is a bitmore complex as we'll see now, it needs an adequatesolution and algorithm. Why is it a bit more complex? Let's have a look at thispair of two sequences. If we apply the hamming distance,compute the hamming between these two sequences,we find ten differences. OK. But you must remember thatmutation may be substitution, deletion and insertion. So if wetake into account the deletion and insertion, the situation isvery different in the case of these two sequences. ...
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le (4m23s)

3èmes États Généraux de la Formation et de la Recherche Médicales - Stress, bien être et stratégies d’apprentissage des étudiants en PACES de la Faculté de Médecine d’Angers

... double cursus Médecine-Sciences de l'Université de Strasbourg.Lamour Valérie (Strasbourg)CA03 : Réforme du DES de médecine générale à l’université Paris Diderot. Gelly Julien (Paris)CA04 : Apport d'un travail d'écriture clinique dans le developpement de...
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le (4m21s)

3.2. Un algorithme simple de prédiction de gènes

Sur la base des principes énoncés précédemment, nous allons écrire un premier algorithme de prédiction de gènes sur un texte génomique procaryote. Je rappelle ces principes. L'idée est la suivante : de rechercher des triplets STOP consécutifs dans la même phase, consécutifs de telle façon qu'effectivement il n'y ait pas un stop qui vienne se mettre au milieu et qui casserait, en quelque sorte, la région codante qui doit être traduite dans son intégralité. Donc, recherche de deux triplets STOP consécutifs, suffisamment éloignés l'un de l'autre pour qu'il y ait de la place pour coder une protéine fonctionnelle. Ensuite, on recherche le ...
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