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le (9m32s)

Les problèmes

Dans cette deuxième séquence, nous allons discuter des problèmes qui vont apparaitre lorsque de nombreuses transactions sont mises en concurrence. En effet, dans le cas général une base de données n'est pas interrogée et modifier par un seul utilisateur. Et en fait, des problèmes d'incohérence vont potentiellement pouvoir apparaître lorsque plusieurs utilisateurs effectuent des opérations conflictuelles et cela peut être dû à un défaut d'isolation. Donc on va essayer de comprendre dans cette séquence quelles sont les incohérences qui peuvent se produire, quelles sont les opérations ou suites d'opérations qui peuvent conduire à l'observation de ces incohérences et enfin comment ...
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le (9m19s)

Verrouillage à 2 phases

Dans cette séquence, nous allons présenter une deuxième manière d'atteindre la sérialisabilité qui est le verrouillage à deux phases ou "two-phase locking" en anglais noté 2PL. En fait, ce qu'on a vu avec l'estampillage, c'est que soit tout se passe bien, soit on choisit d'annuler et de revenir plus tard. C'est un peu comme si dans la vraie vie, plutôt que de faire la queue au guichet de poste et si jamais il y avait des gens, on partirait et puis on reviendrait en espérant un jour qu'il n'y ait personne devant soi. C'est effectivement pas ce qu'on fait, il ...
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le (6m41s)

Indexation : introduction

Dans cette deuxième partie du cours "Bases de données relationnelles", nous allons considérer des techniques d'indexation. Dans une première séquence, nous allons regarder des techniques plutôt introductives. Le but c'est de considérer l'accès à de gros volumes de données et nous allons déjà commencer par parler de technique générale pour faciliter cet accès. Pour accéder à de gros volumes de données, il y a essentiellement deux grands systèmes : les systèmes de fichiers et les systèmes de gestion de bases de données relationnelles (SGBD), le sujet de ce cours...
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Conférences

le (0s)

Francisco Javier RAMON SOLANS (Université de Münster) "Les reliques de Sainte Engrâce et les «innombrables » martyrs de Saragosse. Une dévotion à l'épreuve des temps modernes?"

Ostensions limousines, dévotions aux reliques et fait religieux (Moyen-Age – Epoque contemporaine) Colloque international LE DORAT Salle du cinéma / Vendredi 29 et Samedi 30 avril 2016 CONTACT : lesrdvdelachapelle@laposte.net  "Les reliques de Sainte Engrâce et les «innombrables » martyrs de Saragosse. Une dévotion à l'épreuve des temps modernes?" Francisco Javier RAMON SOLANS (Université de Münster) Le culte aux reliques de Sainte Engrâce et les «innombrables» martyrs de Saragosse fut une des dévotions les plus chères aux habitants de Saragosse. Dans une première partie de ...
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le (1h32m7s)

Territoires 2.0 : vers de nouveaux patrimoines

Avec l’arrivée du web 2.0, l’animation numérique des territoires échappe désormais en partie aux acteurs publics. Le geocaching par exemple, — pratique consistant à découvrir et à déposer des caches à trésors dans l’espace urbain ou ailleurs — est un jeu collaboratif semigratuit, supporté par une société privée et nourri par une communauté mondiale de pratiquants. Il illustre ces nouveaux rapports en train de s’établir entre les internautes organisés en collectif et les territoires. Dans ce type de pratique, le jeu du collectif, sa capacité à ...
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le (5m32s)

1.1. La cellule, atome du vivant

Bienvenue dans cette introduction conjointe aux notions fondamentales de génomique et d'algorithmique, autrement dit, de l'analyse informatique de l'information génétique, ce qu'on peut désigner de façon très synthétique par le terme un domaine scientifique qui est la bio informatique. Au cours de ces 5 parties, nous aborderons des notions fondamentales en commençant par évidemment l'ADN, les séquences génomiques, les textes des génomes, puis de gènes et de protéines et nous nous focaliserons plus particulièrement sur le processus de traduction de gènes en protéines, pour ensuite chercher à concevoir des algorithmes de prédiction de ces gènes dans les textes génomiques, des ...
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le (5m29s)

1.2. Au cœur de la cellule, la molécule d’ADN

Au cœur de chaque cellule se trouve donc la molécule d'ADN, flottant directement dans le cytoplasme dans le cas des cellules procaryotes, par exemple bactériennes, ou contenue dans le noyau des cellules eucaryotes. Que sait-on actuellement de cette molécule d'ADN ? C'est un long parcours là encore de recherche. En 1944, l'ADN était identifié comme étant le support de l'information génétique. Découverte qui a été un peu éclipsée par le travail publié en 1953 sur la structure de la molécule d'ADN. En 1953, on montre que l'ADN est une longue molécule, on l'appellera une macro molécule, composée de 2 brins ...
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le (5m58s)

1.3. L’ADN code l’information génétique

L'ADN, cette longue molécule, porte l'information génétique. Autrement dit, l'information qui est nécessaire à la cellule pour fonctionner et se reproduire. Regardons de plus près cette information génétique. Nous avons vu comment en lisant la séquence de nucléotides le long d'un brin de l'ADN, on pouvait obtenir en fait un texte écrit dans un alphabet de 4 lettres : A, C, G, T. L'opération physico-chimique qui permet de lire la molécule d'ADN s'appelle le séquençage. Cette opération est assez compliquée, nous y reviendrons dans une session ultérieure...
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le (3m57s)

1.4. Qu’est-ce qu’un algorithme ?

Les génomes peuvent donc être vus comme une longue suite de lettres écrites dans l'alphabet : A, C, G et T. Comment interpréter ces textes ? Ça va être le sujet de la bio-informatique à l'aide d'algorithmes appropriés. Qu'entend-on par algorithme ? Un algorithme peut être vu comme une suite d'opérations à exécuter pour résoudre un problème ou, plus généralement, une classe de problèmes. Notre premier algorithme ici, va avoir comme objectif de compter les nucléotides d'une séquence génomique, autrement dit de compter les lettres composant une chaîne de caractères associée à une séquence génomique. Souvent, on utilise la métaphore ...
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le (4m54s)

1.5. Compter les nucléotides

Notre premier algorithme vise assez simplement à compter les nucléotides d'une séquence génomique, autrement dit à compter les lettres dans une chaîne de caractères. En entrée, cette chaîne de caractères, encore une fois écrite dans cet alphabet de 4 lettres, et dont la fin est marquée par un caractère particulier qu'il s'agira de reconnaître. La description d'un algorithme débute par la déclaration de ce qu'on appelle des variables. Ici nous l'avons vu, nous avons plusieurs variables : le nombre de A, le nombre de C, le nombre de G et de T qu'il faudra calculer, le nombre total de lettres ...
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