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  • Bac + 3 (Licence, Licence LMD, licence professionnelle) (132)
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  • SFjRO (1)
  • Université de tous les savoirs au lycée (1)
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374
3.1. All genes end on a stop codon
collection
Favoris
10 vidéos
3. Gene prediction
  • RECHENMANN François
Table of contents 3.1. All genes end on a stop codon 3.2. A simple algorithm for gene prediction 3.3. Searching for start and stop codons 3.4. Predicting all the genes in a sequence 3.5. Making the predictions more reliable 3.6. Boyer-Moore algorithm 3.7. Index and suffix trees 3.8. Probabilistic methods 3.9. Benchmarking the prediction methods 3.10. Gene prediction in eukaryotic genomes
  • Biologie cellulaire
  • Informatique
  • Mathématiques et informatique
  • Biologie cellulaire
  • Informatique
  • Mathématiques et informatique
05.02.2015
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
  • audio 1 audio 2 audio 3
  • document 1 document 2 document 3
3.1. Tous les gènes se terminent sur un codon stop
collection
Favoris
10 vidéos
3. Prédiction des gènes
  • RECHENMANN François
  • PARMENTELAT Thierry
Au sommaire de cette troisième partie : 3.1. Tous les gènes se terminent sur un codon stop 3.2. Un algorithme simple de prédiction de gènes 3.3. À la recherche des codons start et stop 3.4. Prédiction de tous les gènes d'une séquence 3.5. Comment améliorer la qualité des prédictions ? 3.6. L'algorithme de Boyer-Moore 3.7. Index et arbre des suffixes   3.8. Des méthodes probabilistes à la rescousse 3.9. Comment évaluer la qualité de prédiction des méthodes ? 3.10. La prédiction de gènes dans les génomes eucaryotes
  • Informatique
  • Sciences de la vie
  • Informatique
  • Sciences de la vie
01.06.2015
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
  • audio 1 audio 2 audio 3
  • document 1 document 2 document 3
Pour des décisions de justice administrative prédictives ?
Conférence
00:40:38
Favoris
Pour des décisions de justice administrative prédictives ?

Session Le défi de la donnée publique numérique /Justice administrative et donnée publique La conférence a été donnée dans le cadre du colloque annuel de l'Association Française en Droit

14.06.2018
  • document 1 document 2 document 3
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
  • audio 1 audio 2 audio 3
Prédiction d’inondation avec Telemac 2D
Vidéo pédagogique
00:09:46
Favoris
Prédiction d’inondation avec Telemac 2D
Huynh
Thanh Son

Cette séquence est consacrée à l’application du modèle Telemac 2D à la prédiction de l’inondation à Hô-Chi-Minh-Ville, cas où il y a une rupture du barrage de Dau Tieng. Cette présentation comprend 5

  • Géomorphologie
  • Hydrologie
  • Hydraulique
  • Érosion
20.11.2014
  • document 1 document 2 document 3
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
  • audio 1 audio 2 audio 3
3.9. Benchmarking the prediction methods
Vidéo pédagogique
00:05:35
Favoris
3.9. Benchmarking the prediction methods
Rechenmann
François

It is necessary to underline that gene predictors produce predictions. Predictions mean that you have no guarantees that the coding sequences, the coding regions,the genes you get when applying your

05.02.2015
  • document 1 document 2 document 3
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
  • audio 1 audio 2 audio 3
3.5. Comment améliorer la qualité des prédictions ?
Vidéo pédagogique
00:04:44
Favoris
3.5. Comment améliorer la qualité des prédictions ?
Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Il faut toujours le répéter et le souligner, les algorithmes qui déterminent des gènes déterminent des gènes candidats. Ce sont des prédictions de gènes. Donc la question est de savoir s'il est

  • Génomique
  • Algorithmes
  • Bioinformatique
01.06.2015
  • document 1 document 2 document 3
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
  • audio 1 audio 2 audio 3
3.4. Prédiction de tous les gènes d’une séquence
Vidéo pédagogique
00:05:40
Favoris
3.4. Prédiction de tous les gènes d’une séquence
Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

En combinant de façon adéquate la recherche des triplés Stop et Start sur un brin d'ADN, nous avons obtenu un algorithme qui prédit les gènes sur ce brin, mais également sur une phase. C'est-à-dire en

  • Génomique
  • Algorithmes
  • Bioinformatique
01.06.2015
  • document 1 document 2 document 3
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
  • audio 1 audio 2 audio 3
3.2. Un algorithme simple de prédiction de gènes
Vidéo pédagogique
00:04:20
Favoris
3.2. Un algorithme simple de prédiction de gènes
Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Sur la base des principes énoncés précédemment, nous allons écrire un premier algorithme de prédiction de gènes sur un texte génomique procaryote. Je rappelle ces principes. L'idée est la suivante :

  • Génomique
  • Algorithmes
  • Bioinformatique
01.06.2015
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3.10. La prédiction de gènes dans les génomes eucaryotes
Vidéo pédagogique
00:06:20
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3.10. La prédiction de gènes dans les génomes eucaryotes
Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Si nous disposons actuellement de prédicteurs de gènes dans les génomes procaryotes de très bonne efficacité, avec des prédictions relativement fiables, c'est en fait loin d'être le cas sur les

  • Génomique
  • Algorithmes
  • Bioinformatique
01.06.2015
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3.5. Making the predictions more reliable
Vidéo pédagogique
00:04:45
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3.5. Making the predictions more reliable
Rechenmann
François

We have got a bacterial gene predictor but the way this predictor works is rather crude and if we want to have more reliable results, we have to inject into this algorithmmore biological knowledge. We

05.02.2015
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3.10. Gene prediction in eukaryotic genomes
Vidéo pédagogique
00:08:56
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3.10. Gene prediction in eukaryotic genomes
Rechenmann
François

If it is possible to have verygood predictions for bacterial genes, it's certainly not the caseyet for eukaryotic genomes. Eukaryotic cells have manydifferences in comparison to prokaryotic cells. You

05.02.2015
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3.9. Comment évaluer la qualité de prédiction des méthodes ?
Vidéo pédagogique
00:04:01
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3.9. Comment évaluer la qualité de prédiction des méthodes ?
Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Nous avons vu qu'il était possible, ou du moins nous le pensions, améliorer la qualité de prédiction des gènes sur un génome bactérien en introduisant des démarches supplémentaires, de recherches de

  • Génomique
  • Algorithmes
  • Bioinformatique
01.06.2015
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