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317
3.1. Tous les gènes se terminent sur un codon stop
Collection
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10 vidéos
3. Prédiction des gènes
  • RECHENMANN François
  • PARMENTELAT Thierry
Au sommaire de cette troisième partie : 3.1. Tous les gènes se terminent sur un codon stop
3.2. Un algorithme simple de prédiction de gènes 3.3. À la recherche des codons start et stop 3.4. Prédiction de tous les gènes d'une séquence 3.5. Comment améliorer la qualité des prédictions ? 3.6. L'algorithme de Boyer-Moore 3.7. Index et arbre des suffixes   3.8. Des méthodes probabilistes à la rescousse 3.9. Comment évaluer la qualité de prédiction des méthodes ? 3.10. La prédiction de gènes dans les génomes eucaryotes
  • Informatique
  • Sciences de la vie
  • Informatique
  • Sciences de la vie
01.06.2015
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
  • audio 1 audio 2 audio 3
  • document 1 document 2 document 3
3.1. All genes end on a stop codon
Collection
Favoris
10 vidéos
3. Gene prediction
  • RECHENMANN François
Table of contents 3.1. All genes end on a stop codon 3.2. A simple algorithm for gene prediction
3.3. Searching for start and stop codons
3.4. Predicting all the genes in a sequence
3.5. Making the predictions more reliable
3.6. Boyer-Moore algorithm
3.7. Index and suffix trees
3.8. Probabilistic methods
3.9. Benchmarking the prediction methods
3.10. Gene prediction in eukaryotic genomes
  • Biologie cellulaire
  • Informatique
  • Mathématiques et informatique
  • Biologie cellulaire
  • Informatique
  • Mathématiques et informatique
05.02.2015
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
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  • document 1 document 2 document 3
Surveiller en probabilités ? La génétique des traits complexes à l’épreuve de la prédiction
Conférence
00:47:42
Favoris
Surveiller en probabilités ? La génétique des traits complexes à l’épreuve de la prédiction
Bourgain
Catherine

20 février 2015 : Catherine Bourgain (INSERM) Surveiller en probabilités ? La génétique des traits complexes à l’épreuve de la prédiction  Séminaire interdisciplinaire organisé à l’Institut Français

  • Sciences sociales
  • Surveillance
  • Prédiction
  • Médecine
  • Ciblage
20.02.2015
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  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
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3.5. Comment améliorer la qualité des prédictions ?
Vidéo pédagogique
00:04:44
Favoris
3.5. Comment améliorer la qualité des prédictions ?
Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Il faut toujours le répéter et le souligner, les algorithmes qui déterminent des gènes déterminent des gènes candidats. Ce sont des prédictions de gènes. Donc la question est de savoir s'il est

  • Génomique
  • Algorithmes
  • Bioinformatique
  • Biologie application informatique
  • ADN
01.06.2015
  • document 1 document 2 document 3
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
  • audio 1 audio 2 audio 3
3.9. Benchmarking the prediction methods
Vidéo pédagogique
00:05:35
Favoris
3.9. Benchmarking the prediction methods
Rechenmann
François

It is necessary to underline that gene predictors produce predictions. Predictions mean that you have no guarantees that the coding sequences, the coding regions,the genes you get when applying your

  • Biologie application informatique
  • DNA
  • Genome
  • Algorithm
  • Cell
05.02.2015
  • document 1 document 2 document 3
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
  • audio 1 audio 2 audio 3
3.9. Comment évaluer la qualité de prédiction des méthodes ?
Vidéo pédagogique
00:04:01
Favoris
3.9. Comment évaluer la qualité de prédiction des méthodes ?
Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Nous avons vu qu'il était possible, ou du moins nous le pensions, améliorer la qualité de prédiction des gènes sur un génome bactérien en introduisant des démarches supplémentaires, de recherches de

  • Génomique
  • Algorithmes
  • Bioinformatique
  • Biologie application informatique
  • Codon
01.06.2015
  • document 1 document 2 document 3
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
  • audio 1 audio 2 audio 3
Prédiction d’inondation avec Telemac 2D
Vidéo pédagogique
00:09:46
Favoris
Prédiction d’inondation avec Telemac 2D

Cette séquence est consacrée à l’application du modèle Telemac 2D à la prédiction de l’inondation à Hô-Chi-Minh-Ville, cas où il y a une rupture du barrage de Dau Tieng. Cette présentation comprend 5

  • Géomorphologie
  • Hydrologie
  • Hydraulique
  • Érosion
  • Hydrologie. Lacs, fleuves, rivières
20.11.2014
  • document 1 document 2 document 3
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Le réarrangement des communautés en réponse aux changements globaux : des constats 
aux prédictions
Vidéo pédagogique
00:09:59
Favoris
Le réarrangement des communautés en réponse aux changements globaux : des constats aux prédictions
Jiguet
Frédéric

Frédéric Jiguet, professeur au Muséum national d'Histoire naturelle, s'intéresse dans cette vidéo (10'00) au déclin des espèces spécialistes en Europe, et tout particulièrement aux oiseaux. Ce déclin,

  • Communautés
  • Biodiversité. Environnement, protection, conservation
  • Changements globaux
  • Constats
  • Prédictions
30.10.2017
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3.2. Un algorithme simple de prédiction de gènes
Vidéo pédagogique
00:04:20
Favoris
3.2. Un algorithme simple de prédiction de gènes
Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Sur la base des principes énoncés précédemment, nous allons écrire un premier algorithme de prédiction de gènes sur un texte génomique procaryote. Je rappelle ces principes. L'idée est la suivante :

  • Génomique
  • Algorithmes
  • Bioinformatique
  • Biologie application informatique
  • Biologie cellulaire et moléculaire
01.06.2015
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7: Prédiction spatio-temporelle par équations aux dérivées partielles stochastiques (SPDE)
Conférence
00:03:55
Favoris
7: Prédiction spatio-temporelle par équations aux dérivées partielles stochastiques (SPDE)

7: Prédiction spatio-temporelle par équations aux dérivées partielles stochastiques (SPDE)

  • Développement durable
  • Energie
  • Transition énergétique
  • Photovoltaïque
  • Sciences des données
14.12.2020
  • document 1 document 2 document 3
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
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3.10. La prédiction de gènes dans les génomes eucaryotes
Vidéo pédagogique
00:06:20
Favoris
3.10. La prédiction de gènes dans les génomes eucaryotes
Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Si nous disposons actuellement de prédicteurs de gènes dans les génomes procaryotes de très bonne efficacité, avec des prédictions relativement fiables, c'est en fait loin d'être le cas sur les

  • Génomique
  • Algorithmes
  • Bioinformatique
  • Biologie application informatique
  • ADN
01.06.2015
  • document 1 document 2 document 3
  • niveau 1 niveau 2 niveau 3
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SFJRO Caen 2017: Bilan pré thérapeutique et facteurs prédictifs de toxicité.
Cours/Séminaire
00:36:23
Favoris
SFJRO Caen 2017: Bilan pré thérapeutique et facteurs prédictifs de toxicité.

SFJRO Caen 2017: Bilan pré thérapeutique et facteurs prédictifs de toxicité. Pr J Tredaniel ( Hopital Saint Joseph, Paris)

  • Radiothérapie
  • Radiothérapie et électrothérapie
  • SFjRO
  • Caen
  • Cancers bronchiques
30.06.2017
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