Modèle de triplets et de graphes (2)
Nous avons vu dans la séquence précédente que le modèle RDF était un modèle de triplets. Nous allons voir dans cette vidéo qu'il s'agit également d'un modèle de graphe. Un triplet RDF peut en effet
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Nous avons vu dans la séquence précédente que le modèle RDF était un modèle de triplets. Nous allons voir dans cette vidéo qu'il s'agit également d'un modèle de graphe. Un triplet RDF peut en effet
Cette séquence présente les principes du modèle RDF. Il s'agit d'un modèle de triplets et d'un modèle de graphe.
Nous avons écrit le corps de l'algorithme de traduction, et nous avons fractionné la complexité d'écriture de cet algorithme en faisant appel à une fonction qui recherche dans le tableau, qui
Sur la base des principes énoncés précédemment, nous allons écrire un premier algorithme de prédiction de gènes sur un texte génomique procaryote. Je rappelle ces principes. L'idée est la suivante :
We have written an algorithm for finding genes. But you remember that we arestill to write the two functions for finding the next stop codonand the next start codon. Let's see how we can do that. We
Nous allons voir dans cette séquence les spécificités du modèle RDF relatives aux ressources et aux valeurs littérales qui composent des triplets RDF.
La mise en oeuvre d'une structure de données appropriée permet, nous l'avons vu, d'améliorer les performances d'algorithmes. Nous en avons vu l'exemple sur la recherche d'un triplet dans un tableau de
Nous avons écrit la structure, l'ossature d'un algorithme de prédiction de gènes dans un génome bactérien, en utilisant les principes que nous avions énoncés précédemment. Cet algorithme est incomplet
Il y a donc deux approches pour améliorer la performance des algorithmes de recherche d'un motif dans une chaîne de caractères. La première approche consiste à pré-traiter le motif. On a vu un exemple
Dans cette séquence, nous allons voir la partie modification des bases RDF. Cette partie du langage s'appelle SPARQL update et permet d'ajouter, retirer et charger des triplets RDF et également de
Based on the principle we statedin the last session, we will now write in pseudo code a firstalgorithm for locating genes on a bacterial genome. Remember first how this algorithm should work, we first
En écrivant le code de la fonction, qui recherche un triplet dans le tableau qui implémente le code génétique, nous avons terminé et obtenu un algorithme de traduction d'une séquence d'ADN, voire d