Efflorescences de cyanobactéries et bactéries du tube digestif des poissons : un exemple du lien entre écotoxicologie et microbiote

Le microbiote est une « nouvelle frontière » des Sciences de la Vie, dont le rôle clé dans de nombreux aspects de la biologie des organismes est de plus en plus souligné. Souvent localisé à l’interface entre l’hôte et son environnement, le microbiote est exposé aux contaminants et interagit avec eux, rendant sa prise en compte indispensable en écotoxicologie. L’étude de l’impact des efflorescences de cyanobactéries toxinogènes sur le microbiote digestif associé aux poissons téléostéens d’eau douce illustre à la fois le potentiel d’une telle approche intégrée, mais aussi ses difficultés et ses limites conceptuelles comme méthodologiques. A partir d’expérimentations menées au laboratoire et d’observations dans les lacs franciliens, nos résultats montrent que ce stress, le plus fréquent rencontré par les poissons peuplant les plans d’eau, provoque des variations dose-dépendantes de la composition des communautés bactériennes du tube digestif, ainsi que des modifications fonctionnelles qui pourraient découler de ce changement de microbiote. Ce travail souligne la pertinence d’une approche de l’écotoxicologie prenant en compte le microbiote.