Notice
Vers un environnement reproductible pour les bloc-notes Jupyter
- document 1 document 2 document 3
- niveau 1 niveau 2 niveau 3
Descriptif
Les bloc-notes Jupyter sont devenus un élément important dans la boîte à outils de la recherche reproductible, permettant de mêler un récit scientifique à du code et au résultat de son évaluation. Ces bloc-notes souffrent toutefois d’un problème majeur : ils ne déclarent pas l’environnement logiciel dans lequel doit s’exécuter le code.
Cet exposé présente les limites des solutions les plus courantes à ce problème et propose une approche différente. Guix-Jupyter est un « noyau » Jupyter qui permet d’include dans les bloc-notes des annotations de déploiement logiciel mais aussi de dépendance sur des données externes. Guix-Jupyter en est à ses débuts mais il montre déjà que des bloc-notes auto-suffisants et reproductibles sont possibles.
Dans la même collection
-
Packaging dans un centre de Tier 1
LacroixRémiRémi Lacroix nous présente la solution de packaging mise en place par l'IDRIS pour ses utilisateurs.
-
Intégration continue pour le HPC sur PlaFRIM
L'objectif, à travers cette présentation, est d'exposer l'état de l'expérience menée à travers différents centres de partages de ressources. Ce partage concerne en particuliers les responsables de
-
Conteneurs dans un centre de Tier 1
LacroixRémiRémi Lacroix nous présente la solution de conteneurs pour le HPC déployée à l'IDRIS.
-
Notebook Jupyter dans un centre de Tier 1
LacroixRémiRémi Lacroix nous présente comment l'IDRIS a intégré un service de notebooks Jupyter pour les utilisateurs de ces moyens de calcul.
-
FG-Cloud : un Cloud fédéré pluridisciplinaire pour le déploiement et l'orchestration de conteneurs
PansanelJérômeJérôme Pansanel dresse un panaroma de FG-Cloud.
-
Déploiement d'un jupyterhub avec kubernetes - Démonstration
CailletaudRémiRémi Cailletaud donne un tutoriel sur le déploiement d'une instance JupyterHub utilisant des ressources GPU avec Kubernetes
-
Déploiement d'un jupyterhub avec kubernetes - exposé
CailletaudRémiRémi Cailletaud présente le déploiement d'une instance JupyterHub utilisant des ressources GPU avec Kubernetes
-
Conteneurs et runtime pour le HPC
SouchalMartinMartin Souchal présente les solutions actuelles de conteneurisation pour le calcul intensif.
Avec les mêmes intervenants et intervenantes
-
Au-delà des conteneurs : environnements reproductibles avec GNU Guix
CourtèsLudovicCet exposé part de deux constats : la nécessité de déploiements logiciels reproductibles en support de la recherche reproductible et les limitations des outils les plus répandus. Les « gestionnaires
