Archéomiques
Descriptif
Formation en paléo/archéo-génomique pour les archéologues et archéobiologistes (incluant une introduction en paléoprotéomique)
L’écart méthodologique et conceptuel entre les disciplines de l’archéologie (archéozoologie, paléontologie, [paléo]anthropologie, archéozoologie et archéobotanique) et la génétique est un facteur limitant une collaboration pleine, entière et fructueuse entre ces disciplines et induit des erreurs d’appréciation des résultats et de leurs interprétations. L’objectif de la formation était donc de permettre aux archéologues, archéobiologistes et paléontologues d’acquérir une vision transversale des points saillants de la paléo/archéo-génomique afin de leur faciliter l’intégration des concepts issus de ces approches qui sont pertinents pour leur propre discipline.
L’intégralité des conférences de la formation a été filmée et mise en ligne.
Ces conférences procurent un enseignement sur les bases de la génétique, les spécificités de la paléo/archéo-génomique, des aspects techniques importants, les bases de la bioinformatique et des méthodes statistiques, ainsi que les contraintes des référentiels utilisés. Les cours ont abordé les potentiels et limites des analyses paléogénomiques, les protocoles de prélèvements sur le terrain et de conservation, l’impact de certains traitements ou expositions des os sur la préservation de l’ADN, les difficultés de l’analyse paléogénomique des sédiments, la distinction entre séquences contaminantes et séquences « fossiles » authentiques.
Cette formation devrait permettre aux agents des différentes communautés des archéosciences:
- de mieux appréhender ce que la paléo/archéo-génomique a apporté et peut encore apporter à l’archéologie et aux archéosciences
- de mieux appréhender la façon et les modalités selon lesquelles elle peut enrichir les connaissances dans le domaine des archéosciences mais aussi ce qui limite ces apports
- de mieux appréhender en quoi les autres disciplines apportent un cadre d’interprétation indispensables à la paléogénomique
- de s’initier aux concepts d’analyses génétiques les plus récentes qui sous-tendent les publications scientifiques actuelles afin de permettre une collaboration plus efficace entre archéologues/archéoscientifiques et généticiens
- donner des clés de lecture et de compréhension et du recul aux archéologues consultant les publications du domaine
INTERVENANTS :
- Eva-Maria Geigl: Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, Paris
- Thierry Grange: Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, Paris
- Fabien Fauchereau : Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, Paris
- Pierre Kerner: Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, Paris
- Guillaume Achaz : Université de Paris, Musée de l’Homme UMR 7206, Paris
- Diyendo Massilani : Institut Max-Planck d'Anthropologie évolutionniste, Leipzig, Allemagne
- Anne Bridault : ArScAn UMR 7041- Archéologies environnementales, MSH Mondes, Nanterre
- Jérôme Dubouloz : UMR 8215 "Trajectoires », Paris
Vidéos
Formation en paléo/archéo-génomique pour les archéologues et archo-biologistes. 01. Présentation et…
Accueil des participants, présentation des enjeux et du programme
Formation en paléo/archéo-génomique pour les archéologues et archo-biologistes. 02. Introduction à …
Cours d’introduction à la génétique avec un accent sur les aspects importants en paléogénétique et paléogénomique par Fabien Fauchereau.
Formation en paléo/archéo-génomique pour les archéologues et archo-biologistes. 03. Introduction à …
Cours d’introduction à la phylogénétique, l’étude de l’évolution des liens de parenté entre espèces vivants et passés : méthodes de classification, phylogénétique moléculaire, applications.
Formation en paléo/archéo-génomique pour les archéologues et archo-biologistes. 04. Introduction à …
Cours d’introduction à la génétique des populations, l’étude de l’évolution des populations, au travers de la distribution et l’évolution au cours du temps des fréquences de variants génétiques.
Formation en paléo/archéo-génomique pour les archéologues et archo-biologistes. 05. Introduction à …
Introduction à l’analyse des génomes et les différentes techniques utilisées au cours des années pour séquencer les génomes
Formation en paléo/archéo-génomique pour les archéologues et archo-biologistes. 06. Archéozoologie …
Introduction à la paléogénétique et paléogénomique et son apport à l’archéologie : le potentiel, les limites et les biais des approches paléogénétiques .
Formation en paléo/archéo-génomique pour les archéologues et archo-biologistes. 07. ADN ancien dans…
Introduction aux méthodes de l’analyse des données paléogénomiques produites, les séquences d’ADN ancien : leur potentiel et leurs limites et biais
Bioinformatique et analyse statistique (8/10)
Introduction aux méthodes de l’analyse des données paléogénomiques produites, les séquences d’ADN ancien : leur potentiel et leurs limites et biais Concepts et Principes de base de l’analyse des
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Génétique et Archéologie : Chronologie des questionnements des méthodes de l’analyse de la domestication des Sus et des apports respectifs de chacune des disciplines. Evolution des approches
Formation en paléo/archéo-génomique pour les archéologues et archo-biologistes. 10. Archéologie et …
L’expérience d’un archéologue au cours de la collaboration avec des paléogénéticiens
Intervenants et intervenantes
Chimiste et biologiste, spécialiste de l'étude du génome. - En poste à l'Institut Jacques Monod, Université Pierre et Marie Curie, Paris 6 (en 2005). - Directrice de recherche CNRS à l'initiative du laboratoire Paléogénomique et taphonomie moléculaire de l'Institut Jacques Monod, Université de Paris (en 2020).
Auteur d'une thèse de doctorat en Génétique humaine soutenue à l'Université de Paris 7 (en 2004). - Maître de conférences en Génétique Humaine à l’université Paris-Cité, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592 (en 2022)
Biologiste de l’évolution. - Auteur d'une thèse de : sciences biologiques, Université Paris-Sud 11 (en 2009). - Maître de conférences, Université Paris Cité, Institut Jacques Monod, UMR 7592 (en 2022)
Enseignant chercheur en biologie. Docteur en génétique, Université Paris 6 (en 2002). - En poste à l'université de Paris (en 2021) - Membre de l'équipe Anthropologie génétique -AGène-, laboratoire Éco-anthropologie -EAE- UMR 7206, Muséum national d'histoire naturelle -MNHN- (en 2022)
Biologiste. - Auteur d'une thèse en microbiologie à l'Université Paris Diderot-Paris 7 (en 1983). - Chercheur au CNRS, coresponsable du laboratoire Épigénome et paléogénome, Institut Jacques Monod (en 2020)
Chargée de recherche au CNRS, spécialiste en Préhistoire, Archéozoologie, Archéologie environnementale (en 2018). - Directrice de recherches, CNRS - Centre national de la recherche scientifique (en 2022)
Titulaire d'un doctorat de Génomes épigénomes, destin cellulaire préparé à Paris 7 (en 2016). - Enseignant-chercheur en génétique à la Yale school of medicine (en 2022)