Archéomiques

collection
Réalisation : 24 au 26 janvier 2022
Mise en ligne : 07 juillet 2023
DOI : 10.60527/5cze-0385
URL pérenne : https://doi.org/10.60527/5cze-0385
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Archeomique

Descriptif

Formation en paléo/archéo-génomique pour les archéologues et archéobiologistes (incluant une introduction en paléoprotéomique)

L’écart méthodologique et conceptuel entre les disciplines de l’archéologie (archéozoologie, paléontologie, [paléo]anthropologie, archéozoologie et archéobotanique) et la génétique est un facteur limitant une collaboration pleine, entière et fructueuse entre ces disciplines et induit des erreurs d’appréciation des résultats et de leurs interprétations. L’objectif de la formation était donc de permettre aux archéologues, archéobiologistes et paléontologues d’acquérir une vision transversale des points saillants de la paléo/archéo-génomique afin de leur faciliter l’intégration des concepts issus de ces approches qui sont pertinents pour leur propre discipline.

L’intégralité des conférences de la formation a été filmée et mise en ligne.

Ces conférences procurent un enseignement sur les bases de la génétique, les spécificités de la paléo/archéo-génomique, des aspects techniques importants, les bases de la bioinformatique et des méthodes statistiques, ainsi que les contraintes des référentiels utilisés. Les cours ont abordé les potentiels et limites des analyses paléogénomiques, les protocoles de prélèvements sur le terrain et de conservation, l’impact de certains traitements ou expositions des os sur la préservation de l’ADN, les difficultés de l’analyse paléogénomique des sédiments, la distinction entre séquences contaminantes et séquences « fossiles » authentiques.

Cette formation devrait permettre aux agents des différentes communautés des archéosciences:

- de mieux appréhender ce que la paléo/archéo-génomique a apporté et peut encore apporter à l’archéologie et aux archéosciences

- de mieux appréhender la façon et les modalités selon lesquelles elle peut enrichir les connaissances dans le domaine des archéosciences mais aussi ce qui limite ces apports

- de mieux appréhender en quoi les autres disciplines apportent un cadre d’interprétation indispensables à la paléogénomique

- de s’initier aux concepts d’analyses génétiques les plus récentes qui sous-tendent les publications scientifiques actuelles afin de permettre une collaboration plus efficace entre archéologues/archéoscientifiques et généticiens

- donner des clés de lecture et de compréhension et du recul aux archéologues consultant les publications du domaine

 

INTERVENANTS :

  • Eva-Maria Geigl: Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, Paris
  • Thierry Grange: Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, Paris
  • Fabien Fauchereau : Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, Paris
  • Pierre Kerner: Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, Paris
  • Guillaume Achaz : Université de Paris, Musée de l’Homme UMR 7206, Paris
  • Diyendo Massilani : Institut Max-Planck d'Anthropologie évolutionniste, Leipzig, Allemagne
  • Anne Bridault : ArScAn UMR 7041- Archéologies environnementales, MSH Mondes, Nanterre
  • Jérôme Dubouloz : UMR 8215 "Trajectoires », Paris

Vidéos

221118_058_archeomiques_1_presentation_et_enjeux_pad_h264.mp4
Cours/Séminaire
00:05:55

Présentation et enjeux (1/11)

Accueil des participants, présentation des enjeux et du programme

221118_059_archeomiques_2_introduction_a_la_biologie_et_la_genetique_pad_h264_0.mp4
Cours/Séminaire
00:39:37

Introduction à la génétique (2/11)

Cours d’introduction à la génétique avec un accent sur les aspects importants en paléogénétique et paléogénomique par Fabien Fauchereau.

221118_060_archeomiques_3_introduction_a_la_genetique_a_la_phylogenie_pad_h264_0.mp4
Cours/Séminaire
00:57:11

Introduction à la phylogénétique (3/11)

Cours d’introduction à la phylogénétique, l’étude de l’évolution des liens de parenté entre espèces vivants et passés : méthodes de classification, phylogénétique moléculaire, applications.

archeomiques_4_introduction_a_la_genetique_des_populations_reencod
Cours/Séminaire
00:56:08

Introduction à la génétique des populations (4/11)

Cours d’introduction à la génétique des populations, l’étude de l’évolution des populations, au travers de la distribution et l’évolution au cours du temps des fréquences de variants génétiques.

L’analyse des séquences et des données paléogénomique  (7/10)
Cours/Séminaire
00:25:36

L'étude des sédiments (7/11)

Introduction à l’analyse des sédiments : potentiel et limites

221118_065_archeomiques_8_bioinformatique_et_analyse_statistique_pad_h264_0.mp4
Cours/Séminaire
01:16:25

Bioinformatique et analyse statistique (8/11)

Introduction aux méthodes de l’analyse des données paléogénomiques produites, les séquences d’ADN ancien : leur potentiel et leurs limites et biais Concepts et Principes de base de l’analyse des

Archéozoologie et génétique
Cours/Séminaire
01:29:15

Archéolozoologie et génétique (9/11)

Evolution des approches interdisciplinaires à la question de la domestication des suidés et analyse critique des études publiées au fil des années.

Intervenants et intervenantes

France

Chimiste et biologiste, spécialiste de l'étude du génome. - En poste à l'Institut Jacques Monod, Université Pierre et Marie Curie, Paris 6 (en 2005). - Directrice de recherche CNRS à l'initiative du laboratoire Paléogénomique et taphonomie moléculaire de l'Institut Jacques Monod, Université de Paris (en 2020).