Notice
PNLIPRP1, type 2 diabetes and cholesterol : applying mendelian randomisation to validate biologoical findings
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Descriptif
Intervention de Lucas Maurin lors de la journée consacrée à la randomisation mendélienne organisée par le groupe de travail "Statistique & Génomique" du RIS, le 27 octobre 2023
Le gène PNLIPRP1 (Pancreatic Lipase Related Protein 1) a été montré associé au diabète de type 2 et à une augmentation du cholestérol LDL.
La randomisation mendélienne a été utilisée pour déterminer s'il y a un sens dans la relation entre entre PNLIPRP1, le diabète de type 2 et le niveau de cholestérol.
Pour cela, 4 hypothèses ont été testées :
- le diabète de type 2 influence la méthylation de PNLIPRP1
- l'état de méthylation de PNLIPRP1 est associé au diabète de type 2
- le taux de cholestérol influence la méthylation de PNLIPRP1
- l'état de méthylation de PNLIPRP1 est associé au taux de cholestérol
Les résultats ont montré que :
- le diabète de type 2 augmente la méthylation de PNLIPRP1
- plus PNLIPRP1 est méthylé plus le niveau de cholestérol augmente
La randomisation mendélienne permet donc de construire la mécanistique suivante : le diabète de type 2 augmente la méthylation de PNLIPRP1 induisant une diminution du niveau d'expression de ce dernier, ce qui a pour effet de favoriser la synthèse de cholestérol.
Thème
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