The tree of life
ABBY Sophie
Les Rencontres Exobiologiques pour Doctorants (RED) sont une école de formation sur les « bases de l'astrobiologie ». L’édition 2025 s’est tenue du 16 au 21 mars au Parc Ornithologique du Teich.
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ABBY Sophie
Les Rencontres Exobiologiques pour Doctorants (RED) sont une école de formation sur les « bases de l'astrobiologie ». L’édition 2025 s’est tenue du 16 au 21 mars au Parc Ornithologique du Teich.
LAVENIER Dominique
DUPRAZ Elsa
LEBLANC Julien
COATRIEUX Gouenou
Dominique Lavenier, Elsa Dupraz, Julien Leblanc et Gouenou Coatrieux nous présentent le projet dnarXiv, un projet porté par le LabEx CominLabs qui explore le stockage de données sur des molécules d
RECHENMANN François
PARMENTELAT Thierry
Les génomes peuvent donc être vus comme une longue suite de lettres écrites dans l'alphabet : A, C, G et T. Comment interpréter ces textes ? Ça va être le sujet de la bio-informatique à l'aide d
RECHENMANN François
PARMENTELAT Thierry
Une fois la séquence d'un génome complet obtenue, débute la phase d'annotation. L'annotation elle-même consiste tout d'abord à rechercher la localisation, c'est-à-dire la position des gènes sur cette
RECHENMANN François
PARMENTELAT Thierry
Avant de chercher à quantifier ce qu'est la similarité de séquence, on peut se poser la question même de savoir pourquoi des séquences de génome sont similaires entre organismes. La réponse tient dans
RECHENMANN François
PARMENTELAT Thierry
Notre premier algorithme vise assez simplement à compter les nucléotides d'une séquence génomique, autrement dit à compter les lettres dans une chaîne de caractères. En entrée, cette chaîne de
RECHENMANN François
PARMENTELAT Thierry
Il y a donc deux approches pour améliorer la performance des algorithmes de recherche d'un motif dans une chaîne de caractères. La première approche consiste à pré-traiter le motif. On a vu un exemple
RECHENMANN François
PARMENTELAT Thierry
Nous cherchons à concevoir un algorithme capable de déterminer l'alignement optimal de 2 séquences. Et nous avons vu que ça revient à chercher un algorithme qui recherche un chemin optimal dans une
MEUNIER Bernard
Très tôt l’homme a utilisé les produits de la Nature pour traiter les différentes maladies auxquelles il était confronté. Les premiers traités de chimie thérapeutique moderne, décrivant la relation
RECHENMANN François
PARMENTELAT Thierry
Les algorithmes qui travaillent sur les séquences génomiques, sur les textes génomiques, doivent produire des résultats interprétables et utiles aux biologistes. Nous allons voir que même sur l
RECHENMANN François
PARMENTELAT Thierry
Nous avons vu comment la qualité des prédictions de gènes dans un génome bactérien, pouvait être améliorée à travers la recherche d'occurrences de motifs particuliers liés au site de fixation du