Journée "Cycle de vie / Gestion des données de la biologie"
Descriptif
Enjeux : face à la numérisation de la recherche en biologie, la quantité et les débits de données vont croissant. Beaucoup d’équipes de recherche et de laboratoires utilisent encore des stratégies de gestion de données à moyen terme faute de solutions globales et pérennes à leur portée. Avec la mise en place d’une politique de la science ouverte et les incitations des éditeurs pour une mise à disposition des jeux de données lors des publications, de véritables stratégies sont à envisager au quotidien pour anticiper les flux de données. Le développement actuel des outils et leur centralisation pour la gestion et l’analyse s’accompagne de la prise en compte nécessaire de leur cycle de vie afin de paramétrer et anticiper au mieux les besoins.
Contexte : Le déploiement régional des ressources informatiques pour la biologie, porté par l’Equipex 4DOMICs ainsi que l’accès à la base de données OMERO UniCA-EMBRC-Fr, la réflexion sur la bioinformatique portée par l’Académie 4 de l’Idex sont autant de facteurs locaux qui contribuent à avoir une réflexion et une sensibilisation des équipes de recherche en biologie sur UniCA. Cette journée s’inscrit dans le contexte local et national de la science ouverte avec le déploiement des ateliers de la donnée dont DATAZUR, l’Equipex mudis4LS et les stratégies de déploiements de gestion de données des Infrastructures en Biologie Santé dont France BioImaging avec FBI.data.
Objectif : Sensibiliser et acculturer en science ouverte, politique de gestion des données. Cette journée fera le point sur les outils disponibles, ceux en développement ainsi que les ressources en déploiement.
Public : équipes de recherche en biologie, bio&informaticiens, responsables de plateformes...
Date : 4 Avril 2024
Lieu : Sophia-Antipolis, Campus Sophia Tec, Bâtiment F, Amphi Forum
Vidéos
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Intervenants et intervenantes
Ingénieur en ingénierie logicielle chez CCSD - Centre pour la Communication Scientifique Directe (en 2023)
Auteur d'une thèse de doctorat en Sciences de la vie à Nice (en 1990). - Responsable de la plateforme génomique Nice-Sophia Antipolis dans le cadre du Réseau national des génopoles. - Directeur de recherche, responsable de l'équipe "Physiologie génomique des eucaryotes" à l'IPMC (en 2024)
En poste au LBDV Laboratoire de Biologie du développement - Villefranche-sur-mer (2020)
Responsable d'équipe Imag'ic à l'Institut Cochin (2020)
Titulaire du Doctorat en Ingénierie médicale et biologique, Lyon 1 (en 2000). - Ingénieur de Recherche, Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire, Université Côte d’Azur (en 2019, en 2024)
Chercheur à l'INRA, Institut national de la recherche agronomique, Centre de recherches Versailles-Grignon (en 2001). - Administratrice ministérielle des données, des algorithmes et des codes sources, Ministère de l’Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l’Innovation (en 2022)
Titulaire d'un doctorat en Sciences de la vie et de la santé (université Paris-Saclay, 2020)
En poste au département Systèmes biologiques (BIOS) du CIRAD et membre de l'Institut français de biostatistiques (en 2023). - Auteur d'une thèse de doctorat en informatique, systèmes et communications (Grenoble 1, 2004)
Auteur d'une thèse en Sciences et technologie industrielles (en 2012). - Responsable des ressources au pôle de recherche Ampiric (Aix-Marseille – Pôle d’Innovation, de Recherche, d’enseIgnement pour l’éduCation) (en 2024)
Docteur en Physiologie génétique moléculaire à l'Université d'Orléans (en 2005). - Ingénieure bioinformaticienne à l'Université Clermont Auvergne (en 2024)
Documentaliste scientifique à l'INIST (en 2024)
Ingénieure d'étude gestion des données, Institut Français de Bioinformatique (en 2024)
Auteur d'une thèse en Sciences de l'ingénieur à Nice en 1992
Directeur de thèse à l'Université de Nice-Sophia Antipolis (en 2008)
Maître de conférence à l'Université de Nice-Sophia Antipolis (en 2009). Professeur à Université Côte d'Azur (en 2020, 2023). Membre du Laboratoire d'Informatique Signaux et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S)
Ingénieur de Recherche à l'Institut Pasteur (en 2024)
Titulaire d'un doctorat d'université en médecine (Rennes : 2006)
Ingénieur biomédical. Ingénieur de recheches CNRS, Structure fédérative de recherche Santé - François Bonamy (FED 4203, UMS_S 016, UMS_C 3556), Institut de recherche en santé, Université de Nantes (en 2019)
Auteur d'une thèse en Droit privé et Sciences criminelles à Montpellier 1 en 2001. Maître de conférences à l'Université de Montpellier 1 depuis 2004 (en 2011) Maître de conférences de Droit privé et sciences criminelles à Montpellier - Faculté de droit, membre du laboratoire Dynamiques du droit (DDD) (en 2018) Maître de conférences de Droit privé et sciences criminelles à Montpellier - Faculté de droit, membre du laboratoire Laboratoire Innovation Communication et Marché (LICeM) (en 2022)
Ingénieur de recherche, formateur à l'Institut Français de Bioinformatique (en 2024)
Ingénieur logiciel au CNRS (en 2024)