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- Bioinformatique : algorithmes et génomes
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Inria
Bioinformatique : algorithmes et génomes
Dans ce cours, nous verrons comment l’informatique permet d’interpréter le texte des génomes. Doté d’algorithmes adaptés, mis en œuvre sous forme de programmes efficaces, l’ordinateur produit des prédictions quant à la localisation des milliers de gènes d’un organisme vivant et les fonctions que remplissent les protéines qu’ils codent.
Vous n’êtes pas biologiste ? Ce cours vous apportera les connaissances nécessaires à la compréhension des entités et phénomènes biologiques impliqués : cellule, chromosome, ADN, génome, gènes, transcription, traduction, code génétique, protéines, tous ces termes et d’autres encore vous seront expliqués dans ce contexte de l’interprétation des génomes par des moyens informatiques.
Vous n’êtes pas informaticien ? Ce cours se veut simultanément une introduction à l’algorithmique sur des séquences de caractères. Recherche de motifs, similarité de séquences, chaînes de Markov, reconstruction d’arbres phylogénétiques. Les algorithmes de base impliqués dans ces démarches seront présentés.
Vous n’êtes ni biologiste, ni informaticien ? Ce cours est une opportunité pour aborder conjointement la génomique et l’algorithmique, ou si vous préférez, l’algorithmique et la génomique…
Pré-requis
Une culture scientifique de niveau bac scientifique facilitera la compréhension des notions abordées.
Organisation du cours
Ce cours est organisé en 5 parties. Chaque partie est composée de 10 séquences vidéos d'environ 6 minutes.
Plan du cours :
Partie 1
ADN et séquences génomiques
Partie 2
Gènes et protéines
Partie 3
Prédiction des gènes
Partie 4
Comparaison de séquences
Partie 5
Arbres phylogénétiques
Les
différents supports de ce cours sont constitutifs d'un MOOC en 5
semaines hébergé sur la plate-forme France Université Numérique : https://www.fun-mooc.fr/courses/inria/41003S02/session02/about
- 1. ADN et séquences génomiques (10)
- 2. Gènes et protéines (10)
- 3. Prédiction des gènes (10)
- 4. Comparaison de séquences (10)
- 5. Arbres phylogénétiques (7)
