Notice
Évolution des techniques de séquençage des génomes : quelles implications en informatique ?
- document 1 document 2 document 3
- niveau 1 niveau 2 niveau 3
Descriptif
Le génome est l’ensemble du matériel génétique d’un individu ou d’une espèce. La séquence d’ADN, qui en est le support, contient l’information nécessaire à la survie des êtres vivants. Le séquençage, qui consiste à déterminer la suite des acides nucléiques qui la composent, est donc un enjeu de société majeur. Les applications sont nombreuses que ce soit dans le domaine médical ou biologique…Les premières techniques de séquençage sont apparues dans la deuxième moitié des années 1970, et ont constamment évolué depuis. Alors que la première version brouillon du génome humain aura mis plus de dix ans à voir le jour au début des années 2000, et aura coûté plusieurs milliards de dollars, il est aujourd’hui possible de faire séquencer son propre génome pour quelques centaines de dollars, et ce, en quelques jours seulement.
L’évolution de ces techniques, la quantité d’information générée ont un impact considérable sur les outils et méthodes informatiques nécessaires au stockage et à l’analyse de ces données.
Cette présentation s’attachera dans un premier temps à présenter les problématiques informatiques liées au séquençage, ainsi que les différentes solutions apportées au cours de ces dernières décennies, puis conclura sur un certain nombre de problèmes ouverts dans ce domaine.
Sur le même thème
-
Introduction à la randomisation mendélienne
BoisselMathildeIntervention de Mathilde Boissel lors de la journée consacrée à la randomisation mendélienne organisée par le groupe de travail "Statistique & Génomique" du RIS, le 27 octobre 2023
-
Complex traits and mendelian randomization : clues to clinical application
Gichohi-MainaJaredPrésentation d'une application de la randomisation mendélienne
-
PNLIPRP1, type 2 diabetes and cholesterol : applying mendelian randomisation to validate biologoica…
MaurinLucasPrésentation d'une application de la randomisation mendélienne
-
Etude de la structure tridimensionnelle du génome
VaroquauxNelleDétermination de la structure tridimensionnelle du génome
-
Dr Jianbin Wang - Genomes and transcriptomes of the parasitic nematode Ascaris
Nematodes of the genus Ascaris are important parasites of humans and swine, and related genera (Parascaris, Toxocara, and Baylisascaris) infect mammals of veterinary interest. Over the last decade,
-
Les vignes romaines : approches morphométrique et archéogénomique
BoubyLaurentLes vignes romaines : approches morphométrique et archéogénomique
-
Soirée de présentation de l'ouvrage "Sur la trace des suspects"
VaillyJoëlleChauvièreFabienneÀ l'occasion de la parution de l'ouvrage Sur la trace des suspects. L’incorporation de la preuve et de l’indice à l’ère de la génétique (coll. Le (bien) commun), les Éditions de la Maison des sciences
-
Le génome, sujet de l'évolution (cycle L'évolution récente de la biologie évolutive 1/4)
VeuilleMichelAprès que le mendélisme eut révolutionné la biologie évolutive après 1930, la nouvelle génétique évolutive a, à son tour, révolutionné le mendélisme et montré le rôle du génome et des forces qui
-
Daniel-Philippe de SUDRES : Comment les lieux neuro- modifient-ils nos affects?
Daniel-Philippe de SUDRES : Comment les lieux neuro- modifient-ils nos affects?
-
Le vieillissement, normal et pathologique (ASR n°15 - FHU)
Deux fédérations hospitalo-universitaires de l’Université de Lorraine combinent recherche expérimentale et recherche appliquée en centre hospitalier, avec l'ambition de mieux comprendre le
-
EEHU 2017 Génétique et médecine fœtale 03
Journée annuelle 2017 : Etre soignant à l’ère de la bioéthique Réflexions éthiques liées à la Génétique et à la Médecine Foetale La recherche sur l’embryon à l’ère de la génomique. Pierre
-
EEHU 2017 Génétique et médecine fœtale 02
Journée annuelle 2017 : Etre soignant à l’ère de la bioéthique Réflexions éthiques liées à la Génétique et à la Médecine Foetale DAN (diagnostic anténatal) - DPI (diagnostic pré-implantatoire
