Thierry Parmentelat

Parmentelat, Thierry (19..-....)

France
Date de naissance
19XX
Langues d'expression
français
Ingénieur de recherche chez Inria. Exepert du langage de programmation Python (2015)

Thierry Parmentelat a mené une carrière hybride entre les mondes académique et industriel. Ses centres d'intérêt couvrent les langages de programmation, les réseaux, et l'algèbre. Actuellement ingénieur de recherche chez Inria, Thierry Parmentelat utilise Python depuis plus de 10 ans pour ses travaux de recherche, ainsi que pour le développement des plateformes expérimentales dont il a la charge.

Vidéos

3.1. Tous les gènes se terminent sur un codon stop
Vidéo pédagogique
00:04:46

3.1. Tous les gènes se terminent sur un codon stop

Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Une fois la séquence d'un génome complet obtenue, débute la phase d'annotation. L'annotation elle-même consiste tout d'abord à rechercher la localisation, c'est-à-dire la position des gènes sur cette

3.2. Un algorithme simple de prédiction de gènes
Vidéo pédagogique
00:04:20

3.2. Un algorithme simple de prédiction de gènes

Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Sur la base des principes énoncés précédemment, nous allons écrire un premier algorithme de prédiction de gènes sur un texte génomique procaryote. Je rappelle ces principes. L'idée est la suivante :

4.2. Évolution et similarité de séquences
Vidéo pédagogique
00:03:43

4.2. Évolution et similarité de séquences

Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Avant de chercher à quantifier ce qu'est la similarité de séquence, on peut se poser la question même de savoir pourquoi des séquences de génome sont similaires entre organismes. La réponse tient dans

4.4. L’alignement de séquences devient un problème d’optimisation
Vidéo pédagogique
00:04:09

4.4. L’alignement de séquences devient un problème d’optimisation

Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

La distance de Hamming nous donne une première possibilité de mesurer la similarité entre 2 séquences. Mais elle ne reflète pas suffisamment la réalité biologique. Qu'est-ce que j'entends par là ? On

4.1. Comment prédire les fonctions des gènes/protéines ?
Vidéo pédagogique
00:04:31

4.1. Comment prédire les fonctions des gènes/protéines ?

Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Après avoir regardé dans les yeux, les semaines précédentes, l'ADN, vu comment cet ADN par séquençage produisait des textes, des séquences génomiques, étudié la relation entre gènes et protéines,

5.6. La diversité des algorithmes informatiques
Vidéo pédagogique
00:07:56

5.6. La diversité des algorithmes informatiques

Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Nous n'avons vu dans ce cours qu'un exemple extrêmement réduit d'algorithme bio informatique. Il existe en effet une très grande diversité de ces algorithmes bio informatiques qui sont motivés par l

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