Génomique

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RED2025
Cours/Séminaire
01:14:44

The tree of life

Abby
Sophie

Les Rencontres Exobiologiques pour Doctorants (RED) sont une école de formation sur les « bases de l'astrobiologie ». L’édition 2025 s’est tenue du 16 au 21 mars au Parc Ornithologique du Teich.

dnarxiv
Entretien
00:10:52

Le projet dnarXiv : Stockage de données sur des molécules d'ADN

Lavenier
Dominique
Dupraz
Elsa
Leblanc
Julien
Coatrieux
Gouenou

Dominique Lavenier, Elsa Dupraz, Julien Leblanc et Gouenou Coatrieux nous présentent le projet dnarXiv, un projet porté par le LabEx CominLabs qui explore le stockage de données sur des molécules d

3.2. Un algorithme simple de prédiction de gènes
Vidéo pédagogique
00:04:20

3.2. Un algorithme simple de prédiction de gènes

Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

Sur la base des principes énoncés précédemment, nous allons écrire un premier algorithme de prédiction de gènes sur un texte génomique procaryote. Je rappelle ces principes. L'idée est la suivante :

4.4. L’alignement de séquences devient un problème d’optimisation
Vidéo pédagogique
00:04:09

4.4. L’alignement de séquences devient un problème d’optimisation

Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

La distance de Hamming nous donne une première possibilité de mesurer la similarité entre 2 séquences. Mais elle ne reflète pas suffisamment la réalité biologique. Qu'est-ce que j'entends par là ? On

2.6. Algorithmes + structures de données = programmes
Vidéo pédagogique
00:06:11

2.6. Algorithmes + structures de données = programmes

Rechenmann
François
Parmentelat
Thierry

En écrivant le code de la fonction, qui recherche un triplet dans le tableau qui implémente le code génétique, nous avons terminé et obtenu un algorithme de traduction d'une séquence d'ADN, voire d

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