Apport de l'informatique à la génomique des cancers
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Descriptif
La plupart des gènes de notre génome sont présents endeux copies (une sur chaque chromosome homologue). Dans un génome tumoral, enrevanche, il est fréquent d'observer soit des pertes soit, au contraire, desamplifications du nombre de copie d'un gène, conduisant à la dérégulation desprocessus cellulaires et à la prolifération tumorale. Un mécanisme moléculaired'amplification, identifié chez le maïs dans les années 40, consiste dans lerepliement itératif de chromosomes anormaux, possédant deux centromères. Danscet exposé, on montre comment ce processus peut être formalisé par une"grammaire" simple et comment ses traces peuvent être observées dansles données expérimentales issues du séquençage de génomes tumoraux.
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