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2.9. Whole genome sequencing


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Auteur(s) :
RECHENMANN Francois

Producteur Canal-U :
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2.9. Whole genome sequencing

Sequencing is anexponential technology. The progresses in this technologyallow now to a sequence whole genome, complete genome. What does it mean? Well let'stake two examples: some twenty years ago, to sequence the bacillus subtilis bacteria genome took something like ten years,thirty five laboratories and several millions of euros. It was partly a European project,now some hundreds of dollars and it can be done within a day. The human genome project, famoushuman genome project, more than ten years, three billiondollars, 19-91 dollars OK.
Tomorrow certainly less than 1000 dollars per genome, it means that we can now sequence humangenomes, not one but many many human genomes for the sake ofcomparison, diagnosis and so on. So this is a good measure in theevolution of the sequencing technologies, a capacity ofsequencing entire genomes, not part of them, not one gene here, onegene there, the whole genome, to have access to the entiregenetic information of a living organism being a virus, bacteria,a human being, a plant and so on. Let's see what the ordersof magnitudes are. A virus like the influenza is ten tothe power of four letters nucleotides. The bacteria, typical bacteria Escherichia coli, E. coli in English: ten tothe power of six letters. Yeast, famous yeast, you certainly appreciate yeast, it's for beer for example: ten tothe power of seven.

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    Label UNT : UNIT
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    Date de réalisation : 5 Février 2015
    Lieu de réalisation : Grenoble
    Durée du programme : 5 min
    Classification Dewey : biologie application informatique
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    Catégorie : Vidéocours
    Niveau : 1er cycle, 2ieme cycle
    Disciplines : Biologie cellulaire, Informatique, Informatique, Mathématiques et informatique
    Collections : 2. Genes and proteins
    ficheLom : Voir la fiche LOM
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    Auteur(s) : RECHENMANN Francois
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    Langue : Anglais
    Mots-clés : DNA, Genome, algorithm, cell, bioinformatics
    Conditions d’utilisation / Copyright : Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre originale.
 

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