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1.7. DNA walk


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Auteur(s) :
RECHENMANN Francois

Producteur Canal-U :
Inria
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1.7. DNA walk

We will now design a more graphical algorithm which is called "the DNA walk". We shall see what does it mean "DNA walk". Walk on to DNA. Something like that, yes. But first, just have a look again at the typical, also quite short sequence of DNA, a long text offour letters: A, C, G, T, T and so on. When the first sequence of DNA were obtained, the idea of using computers very quickly emerged but people didn't know exactly what to do with this sequence of characters. Again, there is a meaning behind the sequence because it is genetic information. It means it is the information which defines a living organism which defines how it survives, how it reproduces, how it works. So, it has a meaning. How can we discover this meaningin a text again without any markers, spaces and so on. There were some strange ideas but quite sympathetic ideas. A first idea was to say: well, can we turn these genetic sequences into music. Because, we have sequences of characters. Music is a sequence of notes, so maybe we could transform a genetic sequence into a sequenceof notes and make music. And perhaps hearing the music,we will get some ideas about what the meaning of the sequence is. Of course, if we have 4 letters,we only have 4 frequencies.

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    Label UNT : UNIT
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    Date de réalisation : 5 Février 2015
    Lieu de réalisation : Grenoble
    Durée du programme : 7 min
    Classification Dewey : biologie application informatique
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    Catégorie : Vidéocours
    Niveau : 1er cycle, 2ieme cycle
    Disciplines : Biologie cellulaire, Informatique, Informatique, Mathématiques et informatique
    Collections : 1. Genomic texts
    ficheLom : Voir la fiche LOM
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    Auteur(s) : RECHENMANN Francois
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    Langue : Anglais
    Mots-clés : DNA, Genome, algorithm, cell, bioinformatics
    Conditions d’utilisation / Copyright : Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre originale.
 

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