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- Label UNT : UNIT
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- Date de réalisation : 1 Juin 2015
- Durée du programme : 5 min
- Classification Dewey : biologie application informatique
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- Catégorie : Vidéocours
- Niveau : Tous publics / hors niveau, 1er cycle, L1
- Disciplines : Outils, méthode et techniques scientifiques, Informatique
- Collections : 5. Arbres phylogénétiques
- ficheLom : Voir la fiche LOM
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- Auteur(s) : RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry
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- Langue : Français
- Mots-clés : génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation, arbre phylogénétique
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5.3. Remplir un tableau de distances
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5.3. Remplir un tableau de distances
Pour tenter de construire l'arbre phylogénétique d'un ensemble d'espèces, nous allons utiliser les données et génotypique ou des données génotypiques disponibles sur ces espèces. Plus clairement, nous allons utiliser des séquences d'un gène homologue de ces espèces. La première étape va consister à calculer une matrice ou tableau de ces distances. Matrice au tableau? Un point de vocabulaire qui mérite que l'on s'arrête quelques secondes pour l'expliciter. La notion de matrice, c'est une notion mathématique. La matrice est un objet mathématique ayant certaines propriétés; propriétés que l'on étudie et travaille dans le domaine de l'algèbre linéaire. La notion de tableaux est une notion d'informaticiens et de bio informaticien. On en a vu quelques exemples dans les sessions précédentes. Une matrice peut, certes, être implémentée par un tableau, c'est assez naturel mais à l'inverse soyons attentifs ; tout tableau n'est pas une matrice...
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