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3.10. La prédiction de gènes dans les génomes eucaryotes


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Auteur(s) :
PARMENTELAT Thierry
RECHENMANN Francois

Producteur Canal-U :
Inria
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3.10. La prédiction de gènes dans les génomes eucaryotes

Si nous disposons actuellement de prédicteurs de gènes dans les génomes procaryotes de très bonne efficacité, avec des prédictions relativement fiables, c'est en fait loin d'être le cas sur les génomes eucaryotes. Pour quelles raisons ?

La première raison, c'est qu'il existe dans les génomes eucaryotes de très longues régions intergéniques. Les régions intergéniques, ce sont des régions qui se situent entre 2 gènes. Dans un gène bactérien, si vous posez le doigt métaphoriquement parlant évidemment, sur un passage du génome, il y a une forte probabilité que vous soyez dans une région codante. Si vous faites la même chose sur un génome eucaryote, il y a une très forte probabilité que vous soyez sur une région intergénique. A tel point que, dans le génome humain qui est un génome eucaryote, les gènes constituent moins de 5 % de la longueur totale du génome. De plus, les gènes eucaryotes sont interrompus, ils sont structurés en mosaïque. Les régions codantes sont interrompues par ce qu'on appelle des introns, et donc nous avons une structure en exon codant, intron non codant, exon codant, et ainsi de suite...

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    Label UNT : UNIT
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    Date de réalisation : 1 Juin 2015
    Durée du programme : 7 min
    Classification Dewey : biologie application informatique
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    Catégorie : Vidéocours
    Niveau : Tous publics / hors niveau, 1er cycle, L1
    Disciplines : Outils, méthode et techniques scientifiques, Informatique
    Collections : 3. Prédiction des gènes
    ficheLom : Voir la fiche LOM
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    Auteur(s) : RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry
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    Langue : Français
    Mots-clés : ADN, génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
    Conditions d’utilisation / Copyright : Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre originale.
 

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